Universitat Internacional de Catalunya
Inteligencia Artificial II
Otras lenguas de impartición: catalán, castellano
Presentación
Esta segunda parte del curso proporciona una inmersión profunda en la aplicación de técnicas de Inteligencia Artificial (IA) en el campo de la biomedicina.
A lo largo del programa, los estudiantes aprenderán a implementar y evaluar modelos de IA en un contexto biomédico real, abordando desde la predicción de la sensibilidad a los medicamentos hasta la interpretación de variantes genéticas y el reconocimiento de imágenes biomédicas mediante redes neuronales convolucionales.
Requisitos previos
Se recomienda haber cursado y superado:
-
Introducción a la bioinformática
-
Bases de datos biológicas
Se recomienda cursar en paralelo:
-
Inteligencia Artificial I
-
Conocimientos de programación
Objetivos
- Comprender y aplicar técnicas de IA en la biomedicina.
- Desarrollar habilidades prácticas en la limpieza y preparación de datos biomédicos.
- Aprender a construir y evaluar modelos de clasificación y regresión para resolver problemas reales en biomedicina.
- Explorar la aplicación de algoritmos avanzados, como redes neuronales convolucionales, en el análisis de imágenes biomédicas.
Competencias/Resultados de aprendizaje de la titulación
- CB01 - Que los estudiantes hayan demostrado poseer y comprender conocimientos en un área de estudio que parte de la base de la educación secundaria general, y se suele encontrar a un nivel que, si bien se apoya en libros de texto avanzados, incluye también algunos aspectos que implican conocimientos procedentes de la vanguardia de su campo de estudio.
- CB03 - Que los estudiantes tengan la capacidad de reunir e interpretar datos relevantes (normalmente dentro de su área de estudio) para emitir juicios que incluyan una reflexión sobre temas relevantes de índole social, científica o ética.
- CB04 - Que los estudiantes puedan transmitir información, ideas, problemas y soluciones a un público tanto especializado como no especializado.
- CB05 - Que los estudiantes hayan desarrollado aquellas habilidades de aprendizaje necesarias para emprender estudios posteriores con un alto grado de autonomía.
- CE07 - Aplicar las herramientas estadísticas a estudios en Ciencias de la Salud.
- CE19 - Reconocer los principios de las ciencias biomédicas relacionadas con la salud y aprender a trabajar en cualquier ámbito de las ciencias biomédicas (empresa biomédica, laboratorios de bioinformática, laboratorios de investigación, empresa de análisis clínicos, etc.).
- CG07 - Integrar los conceptos básicos relacionados con el campo de la biomedicina tanto a nivel teórico como experimental.
- CG10 - Diseñar, redactar y ejecutar proyectos relacionados con el área de las ciencias biomédicas.
- CG11 - Reconocer conceptos básicos de diferentes ámbitos vinculados a las ciencias biomédicas.
- CT01 - Desarrollar la capacidad de organización y planificación adecuadas al momento.
- CT02 - Desarrollar la capacidad para la resolución de problemas.
- CT03 - Desarrollar la capacidad de análisis y síntesis.
- CT04 - Interpretar resultados experimentales e identificar elementos consistentes e inconsistentes.
- CT05 - Usar internet como medio de comunicación y como fuente de información.
- CT06 - Saber comunicar, hacer presentaciones y redactar trabajos científicos.
- CT07 - Ser capaz de trabajar en equipo.
- CT08 - Razonar y evaluar las situaciones y resultados desde un punto de vista crítico y constructivo.
- CT09 - Tener la capacidad de desarrollar habilidades en las relaciones interpersonales.
- CT10 - Ser capaz de llevar a cabo un aprendizaje autónomo.
- CT11 - Aplicar los conocimientos teóricos a la práctica.
- CT12 - Aplicar el método científico.
- CT13 - Reconocer los aspectos generales y específicos relacionados con el campo de la nutrición y envejecimiento.
- CT14 - Respetar los derechos fundamentales de igualdad entre hombres y mujeres, y la promoción de los derechos humanos y los valores propios de una cultura de paz y de valores democráticos.
Resultados de aprendizaje de la asignatura
- Comprensión Teórica y Aplicación Práctica de la IA en Biomedicina:
- Adquirir una comprensión profunda del papel de la IA en la biomedicina.
- Aplicar la IA en contextos biomédicos, como en el descubrimiento de fármacos y análisis genético.
- Habilidades en Manipulación y Análisis de Datos Biomédicos:
- Desarrollar habilidades prácticas en la limpieza, preparación y análisis de datos biomédicos.
- Interpretar datos genéticos y moleculares en contextos clínicos y de investigación.
- Desarrollo y Evaluación de Modelos de Clasificación y Regresión:
- Construir y evaluar modelos de clasificación y regresión en biomedicina.
- Comprender y aplicar técnicas avanzadas como las redes neuronales convolucionales en el análisis de imágenes biomédicas.
- Evaluación Crítica y Estrategias de Investigación:
- Analizar y evaluar críticamente los resultados de modelos de IA.
- Proponer estrategias de investigación y aplicaciones clínicas basadas en la IA.
- Desarrollo Profesional y Orientación de Carrera:
- Obtener una perspectiva sobre las oportunidades y desafíos en las carreras relacionadas con la bioinformática y la biomedicina.
- Desarrollar habilidades de comunicación y presentación para temas de IA en biomedicina.
Contenidos
- Introducción (2h): El creciente papel de la Inteligencia Artificial en la atención sanitaria. Una visión general de cómo la IA está transformando el campo de la salud y la biomedicina.
- Modelo de Clasificación en Biomedicina.(20h):
- IA en el Descubrimiento de Fármacos.
- Implementación de un pipeline de clasificación desde cero: limpieza de datos, preprocesamiento y evaluación de resultados. Enfoque en la aplicación de IA en el descubrimiento de fármacos desde una perspectiva biomédica.
- Teoría y práctica sobre la preparación de datos y la división de datos, utilizando datos de expresión génica y sensibilidad a medicamentos.
- Entrenamiento y evaluación de un clasificador Random Forest, abordando temas como desequilibrio de clases y selección de características.
- Enfoque en la predicción de sensibilidad de compuestos químicos a líneas celulares específicas, incluyendo representación de huellas químicas y adaptación del pipeline para predecir toxicidad fuera del objetivo.
- Visión general de Deep Learning en el descubrimiento de fármacos y discusión sobre aplicaciones y trayectorias profesionales en bioinformática y biomedicina.
- Modelos de Regresión en Biomedicina (8h)
- Enfoque en predecir el impacto molecular de variantes genéticas mediante modelos de regresión.
- Teoría y ejercicios sobre impacto molecular de variantes y construcción de modelos de regresión.
- Binarización de modelos de regresión, comparación con clasificadores y análisis de herramientas in silico.
- Redes Neuronales Convolucionales en Biomedicina (10h).
- Aplicación de CNN en el análisis de imágenes biomédicas.
- Introducción a las CNN y preparación de datos de imágenes biomédicas.
- Arquitecturas de CNN y optimización de modelos en biomedicina.
- Evaluación de modelos y análisis de resultados en proyectos de IA biomédica.
Metodología y actividades formativas
Modalidad totalmente presencial en el aula
- Clases magistrales: exposición en bloques de entre 15 a 50 minutos, de un tema teórico a desarrollar por parte del profesor.
- Casos clínicos o métodos del caso (MC): Planteamiento de una situación real o imaginaria. Los alumnos trabajan las preguntas formuladas en grupos reducidos o en interacción activa con el profesor y se discuten las respuestas. El profesor interviene activamente y si hace falta aporta nuevos conocimientos.
- Educación virtual (EV): Material online que el alumno puede consultar desde cualquier ordenador, a cualquier hora y que contribuirá al autoaprendizaje de conceptos relacionados con la asignatura.
Sistemas y criterios de evaluación
Modalidad totalmente presencial en el aula
- Alumnos en primera convocatoria:
- Evaluación Continua (35%): Incluye ejercicios prácticos y tests cortos.
- Examen Teórico Final (65%): Evaluación del conocimiento teórico y comprensión de los conceptos de IA II aplicados a la biomedicina vistos durante el curso.
- Componente subjetivo (hasta un 10%): se reservará hasta un 10% de la nota final a criterios subjetivos como la implicación, la participación y el respeto a las normas, para fomentar una actitud activa y comprometida en el aula.
- Alumnos en segunda o posterior convocatoria: la nota de la Evaluación Continua se guarda y el examen final representará un 75% de la nota final.
Puntos generales a tener en cuenta sobre el sistema de evaluación:
- Para poder hacer media, en el examen final se deberá obtener un 5 de nota mínima.
- Además de lo mencionado anteriormente, para aprobar la asignatura, la media de todas las calificaciones ha de ser 5 o superior.
- El carácter continuado de esta evaluación hace que no sea posible evaluar la asignatura si no se ha participado en un 75% de las horas.
- El uso indebido de aparatos electrónicos (como el registro y difusión tanto del alumnado como del profesorado durante las diferentes sesiones, así como el uso de estos aparatos con fines lúdicos y no educativos) puede comportar la expulsión de clase.